המרשם הפלילי כולל גם רישום פלילי, לצד הרישום המשטרתי. הרישום הפלילי כולל את ההרשעות בבתי משפט או בבתי דין צבאיים, לרבות הליכים פליליים אשר הסתיימו ללא הרשעה. ברישום הפלילי מפורטים גם העונשים והצווים שהטיל בית המשפט. הרישום הפלילי הוא ה"עבר הפלילי" של האדם בהתאם למינוח המקובל.

לאחר תקופה מוגדרת, רישום פלילי מתיישן, ולרוב, לאחר תקופה נוספת, הרישום נמחק. יצוין כי לא מדובר במחיקה פיזית, אך כזו שתוביל לכך שגופים מעטים בלבד יוכלו לקבל מידע לגבי רישומים בתקופת מחיקה.

ניתן לפנות בבקשת חנינה מנומקת לנשיא המדינה, כדי לקצר את תקופות ההתיישנות ומחיקה, כדי להביא למחיקת רישום פלילי מהמרשם הפלילי.